HATU ถูกใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ เนื่องจากมีความสามารถในการเพิ่มประสิทธิภาพการเชื่อมโยงระหว่างกรดอะมิโน ซึ่งช่วยลดเวลาและพลังงานที่ใช้ในกระบวนการ นอกจากนี้ยังมีการนำ HATU ไปใช้ในงานวิจัยทางเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารประกอบที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในขั้นตอนการสร้างพันธะเพปไทด์ในห้องปฏิบัติการ นอกจากนี้ HATU ยังมีบทบาทสำคัญในอุตสาหกรรมยา ในการสังเคราะห์ยาชนิดใหม่และการพัฒนายาที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้น เนื่องจากช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเคมีที่แม่นยำและรวดเร็ว