ควินไฮโดรนถูกใช้เป็นหลักในด้านอิเล็กโทรเคมี โดยเฉพาะในการทำหน้าที่เป็นอิเล็กโทรดอ้างอิงที่เรียกว่า "อิเล็กโทรดควินไฮโดรน" ซึ่งใช้ในการวัดค่าพีเอชของสารละลาย โดยอิเล็กโทรดนี้มีข้อดีคือใช้งานง่ายและให้ผลลัพธ์ที่ค่อนข้างแม่นยำในช่วงพีเอชต่ำถึงปานกลาง เหมาะสำหรับการวัดในสารละลายที่ไม่สามารถใช้อิเล็กโทรดแก้วได้ เช่น สารละลายที่มีไอออนโลหะหนักหรือในสภาวะที่ไม่มีน้ำ นอกจากนี้ ควินไฮโดรนยังใช้เป็นสารตัวกลางในการถ่ายโอนอิเล็กตรอนในกระบวนการวิเคราะห์เชิงปริมาณ และมีการประยุกต์ใช้ในงานวิจัยด้านโฟโตเคมีและเซลล์แสงอาทิตย์อินทรีย์ เนื่องจากมีความสามารถในการสร้างและรับอิเล็กตรอนได้อย่างมีประสิทธิภาพ