ไซโตซีน β-D-อะราบิโนฟูราโนไซด์ ไฮโดรคลอไรด์ ถูกใช้หลักในการวิจัยทางการแพทย์และมะเร็งวิทยาในฐานะแอนติเมタโบไลต์และสารเคมีบำบัด มันยับยั้งการสังเคราะห์ DNA โดยรบกวนกระบวนการจำลอง ทำให้มีประสิทธิภาพในการรักษาโรคมะเร็งเม็ดเลือดขาวบางประเภทและมะเร็งอื่นๆ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาภายในห้องปฏิบัติการเพื่อเหนี่ยวนำการหยุดวงจรเซลล์ โดยเฉพาะในระยะ S ซึ่งช่วยให้นักวิจัยสามารถศึกษากลไกของเซลล์และการตอบสนองต่อความเสียหายของ DNA บทบาทในการปรับการเพิ่มจำนวนเซลล์ยังขยายไปถึงการใช้ในการทำความเข้าใจการจำลองของไวรัสและพัฒนากลยุทธ์ต้านไวรัส