Fmoc-α-Me-Ala-OH ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่นิยมใช้ในการสร้างสายเปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพ กลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันที่สามารถกำจัดออกได้ง่ายโดยใช้เบส เช่น ไพเปอรีดีน ทำให้สามารถควบคุมการเติบโตของสายเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ ส่วน α-Me-Ala (α-methylalanine) เป็นกรดอะมิโนที่ไม่ธรรมดาที่ช่วยเพิ่มความเสถียรและปรับปรุงคุณสมบัติทางชีวภาพของเปปไทด์ที่สังเคราะห์ขึ้น สารนี้จึงมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาและสารชีวโมเลกุลที่มีศักยภาพทางการรักษา