ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยของกรดอะมิโนที่มีหมู่ข้างเป็นหมู่ไอโซบิวทิล ซึ่งช่วยสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่มีความเฉพาะเจาะจง โดยหมู่ Fmoc ทำหน้าที่ป้องกันหมู่อะมิโนในระหว่างการสังเคราะห์ และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายด้วยสารละลายเบสอ่อน เช่น แพนเพริดีน ทำให้เหมาะสมกับการสร้างเปปไทด์หลายชั้นอย่างมีประสิทธิภาพ นิยมใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรมเพื่อพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ