ใช้ในห้องปฏิบัติการทางชีววิทยาโมเลกุลสำหรับการตัดดีเอ็นเอที่ลำดับนิวคลีโอไทด์เฉพาะ โดยเอนไซม์นี้จำเพาะต่อตำแหน่งการตัดที่เป็นลำดับเฉพาะ ทำให้เหมาะสำหรับการเตรียมชิ้นดีเอ็นเอในการทำคลอนนิ่ง การวิเคราะห์แผนผังดีเอ็นเอ (restriction mapping) หรือการสร้างไลบรารีดีเอ็นเอ การมีความเข้มข้น 10 ยูนิตต่อไมโครลิตร ช่วยให้สามารถใช้ปริมาณน้อยแต่ได้ผลตัดที่มีประสิทธิภาพ จึงนิยมใช้ในงานวิจัยและงานวินิจฉัยทางพันธุกรรม