อนุพันธ์ฟลูออรีนทำหน้าที่เป็นโครงสร้างที่หลากหลายในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ ช่วยในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนสำหรับการพัฒนายา โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับส่วนประกอบยาสำคัญที่ต้องการโครงสร้างอะโรมาติกที่เสถียร