อินโดลไฮดราไซด์เป็นสารประกอบเฮเทโรไซคลิกที่หลากหลาย ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์ยาและโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ โดยมีกลุ่มฟังก์ชันไฮดราไซด์ติดกับแกนอินโดลเพื่อการปรับแต่งเพิ่มเติมในการค้นพบยาและการสังเคราะห์อินทรีย์