ตัวยับยั้งตัวขนส่งนิวคลีโอไซด์เป็นสารประกอบที่ยับยั้งการทำงานของตัวขนส่งนิวคลีโอไซด์ ซึ่งช่วยอำนวยความสะดวกในการดูดซึมนิวคลีโอไซด์และอนุพันธ์นิวคลีโอไซด์เข้าสู่เซลล์ ตัวยับยั้งเหล่านี้มีความสำคัญสำหรับการศึกษากลไกการขนส่งของเซลล์และการปรับเปลี่ยนประสิทธิภาพของการบำบัดด้วยนิวคลีโอไซด์ในงานวิจัย