สารยับยั้งคาร์บ็อกซิเปปติเดสเป็นสารเคมีที่ยับยั้งเอนไซม์คาร์บ็อกซิเปปติเดสโดยเฉพาะ ซึ่งตัดกรดอะมิโนจากปลาย C-เทอร์มินัสของโปรตีนและเปปไทด์ สารเหล่านี้มีความสำคัญสำหรับการวิจัยเส้นทางโปรตีโอลิติก กลไกเอนไซม์ และการปรับเปลี่ยนการย่อยสลายโปรตีนในระบบชีวภาพเพื่อการบำบัด