สารประกอบนี้ถูกนำไปใช้หลักในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร เนื่องจากโครงสร้างฟลูออรีนที่เป็นเอกลักษณ์ ซึ่งช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรของผลิตภัณฑ์สุดท้าย มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการพัฒนาสารออกฤทธิ์สำหรับยาที่เล็งเป้าไปที่ความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากอะตอมฟลูออรีนช่วยปรับปรุงการทะลุผ่านเกราะป้องกันเลือด-สมอง นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง โดยกลุ่มไตรฟลูออโรเมทิลมีส่วนช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความต้านทานต่อการย่อยสลายในสภาวะสิ่งแวดล้อม บทบาทของมันในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปถึงการสร้างสารเคมีพิเศษที่ใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยเฉพาะในการพัฒนาโพลิเมอร์ขั้นสูงและสารเคลือบที่มีลักษณะการทำงานที่ปรับปรุงแล้ว