1-(2-(ดิฟลูออโรเมทอกซี)ฟีนิล)อีเทนโนน ใช้หลัก ๆ ในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตเภสัชภัณฑ์ต่าง ๆ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) สำหรับยาที่มุ่งเป้าไปยังภาวะทางระบบประสาทและการอักเสบ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ช่วยให้สามารถนำกลุ่มดิฟลูออโรเมทอกซีเข้าสู่โมเลกุลที่ซับซ้อน เพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียร นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในงานวิจัยเคมีเกษตรสำหรับการสังเคราะห์ยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ ๆ โดยซึ่งส่วนดิฟลูออโรเมทอกซีช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกสรร