บริลเลียนท์บลูจีเป็นสีย้อมสังเคราะห์ประเภทไตรอาริลมีเทนที่ใช้หลักในงานห้องปฏิบัติการและการแพทย์ ใช้เป็นสีย้อมทางชีวภาพในกล้องจุลทรรศน์เพื่อแสดงภาพเซลล์ พันธุกรรม หรือเยื่อหุ้มภายใน ในเทคนิค electrophoresis ใช้เป็นสีย้อมสำหรับย้อมโปรตีนหรือเป็นตัวบ่งชี้การติดตาม ในจักษุวิทยา ใช้ในการผ่าตัด vitreoretinal เพื่อย้อมและแสดงภาพจอตาและเยื่อหุ้มภายใน ช่วยเพิ่มความแม่นยำในการผ่าตัด นอกจากนี้ ยังใช้เป็นตัวยับยั้ง gap junction ในงานวิจัยประสาทวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษาการสื่อสารระหว่างเซลล์