สี Coomassie Brilliant Blue G-250 ใช้อย่างแพร่หลายในชีวเคมีสำหรับการย้อมโปรตีนในเจลอิเล็กโทรโฟรีซิส เพื่อการมองเห็นและวัดปริมาณแถบโปรตีน สารนี้จับกับโปรตีนผ่านปฏิกิริยาไฟฟ้าสถิตและไฮโดรโฟบิก ให้สีน้ำเงินที่สามารถวิเคราะห์ด้วยระบบถ่ายภาพ ใช้บ่อยใน Bradford protein assays เพื่อวัดความเข้มข้นโปรตีนในตัวอย่าง เนื่องจากความไวและใช้งานง่าย นอกจากนี้ยังใช้ใน histology สำหรับย้อมเนื้อเยื่อเพื่อศึกษาการกระจายของโปรตีน การประยุกต์ใช้มีความสำคัญในงานวิจัย การวินิจฉัย และการควบคุมคุณภาพในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและชีวเทคโนโลยี