2-trans-Dodecenoyl-CoA ถูกใช้ในการศึกษาทางชีวเคมีและเมแทบอลิซึม โดยเฉพาะในกระบวนการสลายกรดไขมัน (fatty acid oxidation) และการสังเคราะห์ไขมัน (lipid biosynthesis) ในเซลล์ สารนี้เป็นสารกลางที่สำคัญในเมแทบอลิซึมของกรดไขมันไม่อิ่มตัว ช่วยในการวิจัยเกี่ยวกับการทำงานของเอนไซม์และกลไกการควบคุมกระบวนการเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการศึกษาประสิทธิภาพของยาหรือสารประกอบที่ออกแบบมาเพื่อปรับเปลี่ยนกระบวนการเมแทบอลิซึมของไขมัน ซึ่งอาจมีประโยชน์ในการพัฒนาการรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญพลังงาน เช่น โรคอ้วนหรือโรคเบาหวาน