ใช้เป็นสารเคมีสำหรับการป้องกันกลุ่มในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะสำหรับการป้องกันหมู่ไฮดรอกซิล ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกเฉพาะโดยการปกปิดจุดที่ทำปฏิกิริยาได้ในระหว่างการสังเคราะห์หลายขั้นตอน โดยเฉพาะในเคมีของคาร์โบไฮเดรตและนิวคลีโอไซด์ กลุ่มเบนซิโลกซิเมทิลสามารถนำเข้าได้ภายใต้สภาวะอ่อนโยนและคงตัวภายใต้สภาวะปฏิกิริยาหลากหลาย แต่สามารถถูกกำจัดออกอย่างเลือกเฉพาะโดยการไฮโดรเจนโอลิซิสหรือการฮีดรอลิซิสด้วยกรดเมื่อจำเป็น การใช้ช่วยเพิ่มผลผลิตและความจำเพาะในการประกอบโมเลกุลที่ซับซ้อน