ใช้หลัก ๆ เป็นสารเคมีสำหรับกลุ่มป้องกันในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ โดยเฉพาะในการผลิตสายดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอสำหรับงานวิจัยและเภสัชกรรม กลุ่ม 4,4'-dimethoxytrityl จะถูกติดตั้งที่หมู่ 5'-hydroxyl ของนิวคลีโอไซด์เพื่อป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการระหว่างการประกอบสาย การดูดซับ UV ที่แรงช่วยให้สามารถตรวจสอบและทำให้บริสุทธิ์สารกลางได้ง่าย หลังการสังเคราะห์ กลุ่มนี้สามารถถอดออกได้อย่างเลือกเฉพาะภายใต้สภาวะกรดอ่อน ๆ ทำให้เหมาะสมสำหรับการสังเคราะห์แบบเฟสแข็งที่ใช้ในเครื่องสังเคราะห์ดีเอ็นเอแบบอัตโนมัติ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมพื้นผิวที่ถูกฟังก์ชันนัไลซ์และโพรบสำหรับการไบโอคอนจูเกชันและการประยุกต์ใช้ด้านการวินิจฉัย