1,3-Bis(benzyloxy)-2-propanol ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ สารประกอบนี้มีบทบาทสำคัญในการผลิตยาและเคมีภัณฑ์พิเศษ โครงสร้างของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในการพัฒนายาและส่วนประกอบยาสำคัญที่ออกฤทธิ์ (API) นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการปรุงสูตรของโพลิเมอร์และเรซินบางชนิด ซึ่งคุณสมบัติของมันช่วยเพิ่มความเสถียรและประสิทธิภาพในการทำงาน ในสถานที่วิจัย มันถูกใช้สำหรับศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาเส้นทางสังเคราะห์ใหม่