Nonanenitrile ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตน้ำหอมและสารปรุงแต่งกลิ่น หมู่ไนไตรล์ของมันทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าในการสร้างอัลดีไฮด์ กรด และเอมีน ซึ่งจำเป็นในการปรุงน้ำหอมและสารเติมแต่งอาหาร นอกจากนี้ ยังเป็นสารตั้งต้นในการผลิตยา ซึ่งช่วยในการพัฒนาส่วนผสมที่ใช้งานได้ ในงานอุตสาหกรรม nonanenitrile ถูกใช้ในการผลิตพลาสติไซเซอร์และโพลิเมอร์ เพิ่มความยืดหยุ่นและความทนทาน บทบาทในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปถึงสารเคมีเกษตร ซึ่งช่วยในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช