Harmaline hydrochloride dihydrate ใช้หลักในการวิจัยเนื่องจากคุณสมบัติ psychoactive และ neuropharmacological โดยทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้ง monoamine oxidase A (MAO-A) ที่ย้อนกลับได้ ทำให้มีคุณค่าในการศึกษาการควบคุมสารสื่อประสาทและการรักษาโรคทางจิตเวช ความสามารถในการปรับระดับ serotonin และ dopamine ได้นำไปสู่การสำรวจเพื่อทำความเข้าใจโรคอารมณ์ ภาวะซึมเศร้า และความวิตกกังวล นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัย ethnopharmacological เพื่อศึกษาการแพทย์แบบดั้งเดิม โดยเฉพาะในบริบทของ ayahuasca ซึ่งมีบทบาทสำคัญในผล psychoactive การประยุกต์ใช้ใน neurobiology ยังขยายไปถึงการตรวจสอบโรค neurodegenerative และการแทรกแซงทาง درمانیที่เป็นไปได้