Bis-propargyl-PEG4 ใช้ในการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในกระบวนการ click chemistry ซึ่งเป็นเทคนิคที่นิยมใช้ในการเชื่อมโยงโมเลกุลต่าง ๆ เข้าด้วยกันอย่างมีประสิทธิภาพ เนื่องจากมีกลุ่ม propargyl ที่สามารถทำปฏิกิริยาได้ง่ายกับ azides ผ่านปฏิกิริยา cycloaddition นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาและสารชีวโมเลกุล เช่น การปรับเปลี่ยนโปรตีนหรือเปปไทด์ เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพหรือการนำส่งยา รวมถึงการประยุกต์ใช้ในวัสดุศาสตร์เพื่อสร้างโครงสร้างพอลิเมอร์ที่มีความซับซ้อนและมีคุณสมบัติเฉพาะทาง