endo-BCN-PEG2-acid ใช้ในด้านชีววิทยาโมเลกุลและเคมีชีวภาพเพื่อการเชื่อมโยงโมเลกุลที่มีความเฉพาะเจาะจงสูง โดยเฉพาะในเทคนิคการติดฉลากและการตรวจจับโมเลกุลเป้าหมาย ด้วยโครงสร้างที่มีกลุ่ม BCN (bicyclo[6.1.0]nonyne) ซึ่งสามารถเกิดปฏิกิริยาแบบไม่มีตัวเร่งกับ azides ได้อย่างรวดเร็วและเฉพาะเจาะจง ทำให้สารนี้ถูกนำไปใช้ในงานวิจัยที่เกี่ยวข้องกับเซลล์และเนื้อเยื่อ เช่น การติดตามโมเลกุลในระบบชีวภาพ การพัฒนายา และการสร้างวัสดุชีวภาพ นอกจากนี้ กลุ่ม PEG ในโครงสร้างยังช่วยเพิ่มความละลายน้ำและลดความเป็นพิษของโมเลกุล ทำให้เหมาะสำหรับการใช้งานในสภาวะทางชีวภาพ