Propargyl-PEG4-O-C1-NHS ester ใช้เป็นสารเชื่อมโยงในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมีชีวภาพ โดยเฉพาะในการเชื่อมต่อโมเลกุลเป้าหมายกับสารชีวโมเลกุล เช่น โปรตีนหรือเปปไทด์ เนื่องจากมีกลุ่มเอสเทอร์ที่สามารถทำปฏิกิริยากับกลุ่มอะมิโนได้อย่างมีประสิทธิภาพ และกลุ่มโพรพาร์ไจล์ที่สามารถเข้าร่วมปฏิกิริยา Click Chemistry เช่น CuAAC (Copper-Catalyzed Azide-Alkyne Cycloaddition) ได้ ทำให้เป็นสารสำคัญในการพัฒนาเวชภัณฑ์ การวิจัยทางเภสัชกรรม และการสร้างวัสดุนาโนชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการติดฉลากโมเลกุลเพื่อการติดตามและการศึกษาเชิงวิเคราะห์ในห้องปฏิบัติการอีกด้วย