6-Ethynylnicotinonitrile เป็นสารประกอบที่ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น กลุ่มเอทไธนิลของมันทำให้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการทำปฏิกิริยาเคมีคลิก เช่น การ cycloaddition แบบ azide-alkyne ที่มีตัวเร่งทองแดง (CuAAC) ซึ่งถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการค้นพบยา วิทยาศาสตร์วัสดุ และ bioconjugation นอกจากนี้ กลุ่มฟังก์ชันไนไตรล์ในโมเลกุลสามารถถูกปรับเปลี่ยนหรือไฮโดรไลซ์ ทำให้สามารถใช้ในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ สารเคมีเกษตร และเคมีภัณฑ์ละเอียดอื่นๆ ความหลากหลายและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาสารประกอบที่ออกฤทธิ์ทางชีวภาพและวัสดุฟังก์ชัน