mPEG-Alkyne ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านชีววิทยาและเคมี โดยเฉพาะในการสังเคราะห์และปรับเปลี่ยนโมเลกุลทางชีวภาพ เนื่องจากมีกลุ่ม alkyne ที่สามารถทำปฏิกิริยา click chemistry กับ azide ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้เหมาะสำหรับการติดฉลากโมเลกุล เช่น โปรตีน, เปปไทด์, และ oligonucleotides เพื่อการศึกษาด้านชีวภาพและการวินิจฉัย นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาและระบบนำส่งยา โดยการเชื่อมต่อกับโมเลกุลเป้าหมายเพื่อเพิ่มการละลายและความเสถียรของยา รวมถึงการปรับปรุงประสิทธิภาพในการส่งมอบยาไปยังเซลล์หรือเนื้อเยื่อที่ต้องการ ในด้านนาโนเทคโนโลยี mPEG-Alkyne ถูกใช้ในการสร้างวัสดุนาโนที่สามารถนำไปประยุกต์ใช้ในการถ่ายภาพทางการแพทย์หรือการบำบัดโรค เช่น การสร้างอนุภาคนาโนที่สามารถจับกับเซลล์มะเร็งได้อย่างเฉพาะเจาะจง การใช้งานเหล่านี้ทำให้ mPEG-Alkyne เป็นสารเคมีที่มีความสำคัญในการวิจัยและพัฒนาทางวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีชีวภาพในปัจจุบัน