Pent-4-yn-1-amine hydrochloride ถูกนำไปใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารตั้งต้นสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น กลุ่มอัลไคน์ปลายทางของมันทำให้เป็นสารเคมีที่มีค่ามากในเคมีคลิก โดยเฉพาะในปฏิกิริยา cycloaddition แบบ azide-alkyne ที่มีตัวเร่งทองแดง (CuAAC) ซึ่งถูกนำไปใช้อย่างกว้างขวางในการค้นพบยา การเชื่อมโยงทางชีวภาพ และวิทยาศาสตร์วัสดุ กลุ่มอะมีนช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ สนับสนุนการใช้ในการสังเคราะห์ยา สารเคมีเกษตร และสารชีวภาพที่มีฤทธิ์ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการพัฒนาโพลิเมอร์และเดนดริเมอร์ โดยที่ปฏิกิริยาของมันสามารถนำไปใช้ในการสร้างโครงสร้างที่ปรับแต่งได้ตามต้องการพร้อมคุณสมบัติเฉพาะ