อัลลิลามีนไฮโดรคลอไรด์ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์สารต้านเชื้อรา โดยเฉพาะในการผลิตเทอร์บินาฟีน ซึ่งเป็นยาที่มีประสิทธิภาพต่อการติดเชื้อรา เช่น โรคเท้าเหม็นและกลาก มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาเภสัชกรรม ทำให้สามารถพัฒนาสารประกอบที่ยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อรา นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างอนุพันธ์อัลลิลต่างๆ ซึ่งจำเป็นในการผลิตโพลิเมอร์ เรซิน และสารเคมีพิเศษอื่นๆ บทบาทของมันในการทำปฏิกิริยาข้ามพันธะยังทำให้มีคุณค่าต่อการปรุงสูตรกาวและสารเคลือบผิว