ไอโซเพนไทลามีน ไฮโดรคลอไรด์ ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการเตรียมสารประกอบเคมีต่างๆ มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่ระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร เช่น สมุนไพรกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง เนื่องจากบทบาทในการสร้างส่วนประกอบที่ใช้งานได้ ในสาขาวิทยาศาสตร์วัสดุ มันถูกนำมาใช้ในการปรับเปลี่ยนโพลิเมอร์และเรซินเพื่อเพิ่มคุณสมบัติ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการสังเคราะห์สีย้อมและเม็ดสี ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารกลางในการสร้างสารให้สีสำหรับสิ่งทอและวัสดุอื่นๆ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยในฐานะตัวเร่งปฏิกิริยาสำหรับการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและพัฒนาเส้นทางสังเคราะห์ใหม่