สารเคมีนี้ใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีน โดยเฉพาะในขั้นตอนการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันอะมีน (amine protection) ในระหว่างการสร้างพันธะเปปไทด์ กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ที่อยู่ในโครงสร้างช่วยป้องกันกลุ่มอะมีนไม่ให้เกิดปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์

นอกจากนี้ กลุ่ม PFP (pentafluorophenyl) ในโมเลกุลยังช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการเกิดปฏิกิริยา esterification หรือ amidation ทำให้สารนี้เหมาะสำหรับการเชื่อมโยงโมเลกุลต่างๆ ในสภาวะที่อ่อนโยน

อีกทั้ง PEG (polyethylene glycol) ที่อยู่ในโครงสร้างยังช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายในตัวทำละลายอินทรีย์ ช่วยให้กระบวนการสังเคราะห์เป็นไปอย่างราบรื่นและมีประสิทธิภาพมากขึ้น

โครงสร้างของสารนี้ช่วยให้สามารถกำจัดกลุ่มป้องกัน (deprotection) ได้อย่างมีประสิทธิภาพภายใต้สภาวะกรดอ่อนๆ โดยไม่รบกวนโครงสร้างเปปไทด์มากนัก ทำให้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อน ซึ่งต้องการความแม่นยำและการควบคุมสภาวะปฏิกิริยาอย่างละเอียด

นอกจากนี้ ความเสถียรและโปรไฟล์การตอบสนองทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) ซึ่งช่วยในการผลิตเปปไทด์ความบริสุทธิ์สูงสำหรับการวิจัยทางเภสัชกรรมและชีวเคมี

โดยรวมแล้ว สารนี้มีบทบาทสำคัญในงานวิจัยทางเคมีชีวภาพและการพัฒนายา โดยเฉพาะในขั้นตอนการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน