Phthalimidoacetone ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางในการผลิตเภสัชภัณฑ์และเคมีภัณฑ์ละเอียดต่างๆ มีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์และเปปไทโดมิมเมติกส์ โดยทำหน้าที่เป็นกลุ่มปกป้องสำหรับกรดอะมิโนในปฏิกิริยาที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารชีวภาพ รวมถึงสารที่มีศักยภาพต้านจุลชีพหรือต้านมะเร็ง คุณสมบัติการทำปฏิกิริยาและความเสถียรทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในการสร้างโครงสร้างเฮเทโรไซคลิกและโมเลกุลเฉพาะอื่นๆ ในเคมียารักษา