เบนซิล คลอโรฟอร์เมต ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการป้องกันกลุ่มอะมิโนระหว่างการสังเคราะห์เปปไทด์ มันทำหน้าที่เป็นสารป้องกันสำหรับเอมีน โดยการก่อตัวของอนุพันธ์คาร์บาเมตที่เสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ คุณสมบัตินี้ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างเปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อนแบบขั้นตอน โดยรับประกันว่าอะมิโนกรดเฉพาะจะไม่ได้รับผลกระทบในปฏิกิริยาต่อไป

นอกจากการสังเคราะห์เปปไทด์แล้ว ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมเภสัชภัณฑ์และเคมีภัณฑ์ละเอียด ความสามารถในการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันอย่างเลือกสรรช่วยให้ควบคุมการแปลงเคมีได้อย่างแม่นยำ ซึ่งเป็นสิ่งสำคัญในการพัฒนายาและสารประกอบชีวภาพ

นอกจากนี้ เบนซิล คลอโรฟอร์เมต ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์โพลิเมอร์และเรซิน โดยทำหน้าที่เป็นสารดัดแปลงเพื่อนำกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะเข้าไปในโซ่โพลิเมอร์ ซึ่งช่วยเพิ่มคุณสมบัติของวัสดุ ทำให้เหมาะสำหรับการใช้งานในสารเคลือบ กาว และวัสดุขั้นสูง

โดยรวม ความหลากหลายในการป้องกันและดัดแปลงกลุ่มฟังก์ชันทำให้เป็นสารเคมีที่จำเป็นในทั้งการวิจัยทางวิชาการและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม