BAPTA-AM ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีววิทยาในฐานะสารจับแคลเซียมที่สามารถแทรกซึมเข้าเซลล์ได้ (cell-permeable calcium chelator) มันช่วยควบคุมหรือ缓冲ระดับแคลเซียมภายในเซลล์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้มีคุณค่าในการศึกษากระบวนการที่ขึ้นอยู่กับแคลเซียมในเซลล์ นักวิจัยมักใช้เพื่อตรวจสอบบทบาทของการส่งสัญญาณแคลเซียมในหน้าที่ของเซลล์ เช่น การหดตัวของกล้ามเนื้อ การปล่อยสารสื่อประสาท และการตายของเซลล์ (apoptosis) ความสามารถในการจับแคลเซียมอย่างเลือกเฉพาะโดยไม่กระทบต่อไอออนอื่น ๆ ทำให้เป็นเครื่องมือที่แม่นยำสำหรับการปรับ操控ความเข้มข้นแคลเซียมภายในเซลล์ในสภาพการทดลอง นอกจากนี้ BAPTA-AM ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาที่มุ่งเน้นบทบาทของแคลเซียมในความเสียหายหรือการตายของเซลล์ โดยให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกลไกของโรค เช่น การเสื่อมของระบบประสาท (neurodegeneration) หรือภาวะขาดเลือด (ischemia) การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่เภสัชวิทยา ซึ่งช่วยประเมินผลกระทบของยาต่อทางเดินที่เกี่ยวข้องกับแคลเซียม