Vra-GlcNAc ใช้หลักๆ ในงานวิจัยทางชีวเคมีและเซลล์เป็นเครื่องมือตรวจสอบ (probe) สำหรับศึกษากระบวนการไกลโคซิเลชันและการสังเคราะห์ผนังเซลล์ในแบคทีเรีย โดยทำหน้าที่เป็นตัวติดตามทางเมแทบอลิซึม (metabolic label) ที่สามารถรวมเข้าไปในเปปไทโดไกลแคน (peptidoglycan) และโพลิเมอร์ผนังเซลล์ที่เกี่ยวข้อง ทำให้สามารถตรวจจับและถ่ายภาพพลวัตของผนังเซลล์แบคทีเรียผ่านเทคนิคเช่นกล้องจุลทรรศน์ฟลูออเรสเซนส์เมื่อคู่กับแท็กที่เหมาะสม

มีคุณค่าอย่างยิ่งในการศึกษากลไกดื้อยาปฏิชีวนะ เนื่องจากช่วยแสดงภาพกิจกรรมของเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการปรับโครงสร้างผนังเซลล์ (cell wall remodeling) นักวิจัยใช้ Vra-GlcNAc เพื่อติดตามการแสดงออกและหน้าที่ของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับ VraSR regulon ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการตรวจจับความเครียดของผนังเซลล์ในแบคทีเรียแกรมบวก เช่น Staphylococcus aureus

นอกจากนี้ ยังสนับสนุนการพัฒนายาต้านจุลชีพชนิดใหม่โดยช่วยติดตามแบบเรียลไทม์ของการยับยั้งหรือรบกวนการสังเคราะห์ผนังเซลล์ที่เกิดจากตัวยาที่เป็นผู้มารับการทดสอบ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการศึกษาการโต้ตอบระหว่างโฮสต์และพาธาเจน โดยการติดฉลากด้วย Vra-GlcNAc ช่วยในการแยกแยะเซลล์แบคทีเรียจากเซลล์โฮสต์ในระบบเพาะร่วม (co-culture systems)