สารเคมีนี้ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาเพปไทด์และ bioconjugates กลุ่มปกป้อง Fmoc ช่วยให้สามารถถอดออกได้อย่างเลือกสรรในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งช่วยควบคุมการประกอบโซ่เปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ กลุ่มฟังก์ชัน aminooxy สนับสนุนปฏิกิริยา oxime ligation ซึ่งเป็นปฏิกิริยาสำคัญในการ bioconjugation ช่วยให้สามารถติดเปปไทด์กับโมเลกุลอื่นๆ เช่น โปรตีน ยา หรือแท็กเรืองแสง สเปเซอร์ PEG4 ช่วยเพิ่มความละลายน้ำและความยืดหยุ่น ลดการขัดขวางเชิง steric และปรับปรุงประสิทธิภาพของปฏิกิริยาการเชื่อมต่อ ทำให้มีคุณค่ากในการสร้างระบบส่งยาแบบกำหนดเป้าหมาย โพรบวินิจฉัย และ antibody-drug conjugates นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาวัคซีนเพปไทด์และการศึกษาการโต้ตอบโปรตีน-โปรตีน