T-Boc-aminooxy-peg4-propargyl ใช้เป็นสารสำคัญในการสังเคราะห์และการปรับแต่งโมเลกุลในกระบวนการทางเคมีชีวภาพ โดยเฉพาะในด้านชีววิทยาโมเลกุลและนาโนเทคโนโลยี มันถูกนำมาใช้ในการเชื่อมโยงโมเลกุลต่างๆ ผ่านปฏิกิริยาเคมีคลิก (click chemistry) ซึ่งช่วยในการสร้างโครงสร้างที่ซับซ้อนได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในการพัฒนายาและระบบนำส่งยา โดยช่วยในการปรับปรุงประสิทธิภาพและความแม่นยำของการส่งยาไปยังเซลล์เป้าหมาย รวมถึงใช้ในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ระหว่างโมเลกุลในงานวิจัยทางวิทยาศาสตร์อีกด้วย