ใช้เฮปเทนเป็นตัวทำละลายในอุตสาหกรรม เนื่องจากมีคุณสมบัติในการละลายสารอินทรีย์ได้ดี โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตกาว หมึกพิมพ์ และสี นอกจากนี้ยังใช้เป็นมาตรฐานในการวัดเลขออกเทนของเชื้อเพลิงในห้องปฏิบัติการ เพราะเฮปเทนมีเลขออกเทนต่ำ จึงใช้เปรียบเทียบคุณภาพของน้ำมันเชื้อเพลิงได้อย่างแม่นยำ ยังมีการใช้ในห้องปฏิบัติการวิเคราะห์ทางเคมี เช่น การสกัดสารหรือเป็นเฟสเคลื่อนที่ในโครมาโตกราฟี