มีลไซโคลเฮกเซนถูกใช้เป็นตัวทำละลายในอุตสาหกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการที่ต้องการตัวทำละลายอินทรีย์ที่มีความระเหยปานกลาง มันยังถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอื่น ๆ เช่น ในการผลิตพลาสติก ยางสังเคราะห์ และสารเคลือบต่าง ๆ นอกจากนี้ยังสามารถใช้เป็นส่วนผสมในเชื้อเพลิงบางประเภทเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติการเผาไหม้ และใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อศึกษาพฤติกรรมของสารไซโคลอัลเคน