ฟรุกวินิทินิบใช้ในการรักษามะเร็งลำไส้ใหญ่และทวารหนักที่ลุกลามหรือแพร่กระจายในผู้ป่วยที่เคยได้รับการรักษาด้วยวิธีการอื่นมาแล้ว แต่ไม่ตอบสนองต่อการรักษาหรือไม่สามารถทนต่อผลข้างเคียงได้ ยานี้เป็นยาต้านมะเร็งประเภทยับยั้งการสร้างเส้นเลือดใหม่ (anti-angiogenic) ซึ่งช่วยชะลอการเติบโตและแพร่กระจายของเซลล์มะเร็งโดยการตัดเสบียงเลือดที่ไปเลี้ยงก้อนมะเร็ง นอกจากนี้ยังอาจใช้ในกรณีอื่นๆ ตามดุลยพินิจของแพทย์ผู้เชี่ยวชาญ