Branebrutinib ถูกนำมาใช้เป็นหลักในการรักษาโรคภูมิต้านตนเอง (autoimmune diseases) โดยเฉพาะโรคที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางการส่งสัญญาณของเซลล์ B มันทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้ง Bruton’s tyrosine kinase (BTK) ซึ่งช่วยปรับการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกันโดยการกำหนดเป้าหมายเส้นทางเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบและโรคภูมิต้านตนเอง ทำให้มีประสิทธิภาพในภาวะเช่น โรครูมาตอยด์ (rheumatoid arthritis) หลูปัส (lupus) และโรคภูมิต้านตนเองระบบอื่นๆ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาวิจัยศักยภาพในการรักษาโรคมะเร็งบางชนิด โดยเฉพาะมะเร็งที่ขับเคลื่อนโดยเซลล์ B malignancies เนื่องจากความสามารถในการยับยั้ง BTK ซึ่งเป็นปัจจัยสำคัญในการเพิ่มจำนวนและการรอดชีวิตของเซลล์ B กลไกการทำงานที่กำหนดเป้าหมายนี้ให้แนวทางที่แม่นยำยิ่งขึ้นเมื่อเทียบกับการบำบัดยับยั้งภูมิคุ้มกันแบบดั้งเดิม ซึ่งอาจลดผลข้างเคียงในขณะที่เพิ่มประสิทธิภาพ