ฟอสโฟมัยซิน แคลเซียม ใช้หลักๆ เป็นยาปฏิชีวนะในยาสัตว์แพทย์ โดยเฉพาะสำหรับการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียในปศุสัตว์และสัตว์ปีก มีประสิทธิภาพต่อแบคทีเรียแกรมบวกและแกรมลบหลายชนิด ทำให้เป็นตัวเลือกที่หลากหลายสำหรับจัดการภาวะเช่น การติดเชื้อทางเดินหายใจ การติดเชื้อทางเดินอาหาร และการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะในสัตว์ นอกจากนี้ มักให้ในอาหารหรือน้ำเพื่อความสะดวกในการให้ยาและการปฏิบัติตาม การมีบทบาทในการส่งเสริมสุขภาพสัตว์ช่วยเพิ่มผลผลิตและลดการแพร่กระจายของโรคติดเชื้อในระบบเกษตรกรรม