เซอร์โคสปอรินถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางชีววิทยาและเกษตรกรรมเป็นหลัก เนื่องจากมีความสามารถในการสร้างออกซิเจนเชิงเดี่ยว (singlet oxygen) เมื่อถูกกระตุ้นด้วยแสง ซึ่งเป็นคุณสมบัติที่ทำให้มันมีศักยภาพในการใช้เป็นสารกำจัดวัชพืชหรือเชื้อราทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการควบคุมโรคพืชที่เกิดจากเชื้อรา นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาการนำเซอร์โคสปอรินไปใช้ในด้านการแพทย์ เช่น การวิจัยเกี่ยวกับการทำลายเซลล์มะเร็งโดยใช้แสง (photodynamic therapy) เนื่องจากความสามารถในการสร้างออกซิเจนเชิงเดี่ยวที่สามารถทำลายเซลล์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ