เอทโทอินใช้เป็นยากันชัก โดยอยู่ในกลุ่มยาต้านการชักชนิดไฮแดนทอยด์ (hydantoin) เช่นเดียวกับฟีนิโทอิน แต่มีฤทธิ์น้อยกว่าและมักใช้ในกรณีที่ผู้ป่วยไม่สามารถทนต่อผลข้างเคียงของฟีนิโทอินได้ ยาชนิดนี้ช่วยควบคุมการเกิดไฟฟ้าผิดปกติในสมองที่ทำให้เกิดอาการชัก โดยเฉพาะอาการชักชนิดโทนิก-คลอนิกและพาร์เชียลซีซั่ร์ อย่างไรก็ตาม เอทโทอินมีประสิทธิภาพน้อยกว่ายาต้านชักชนิดอื่น จึงไม่ใช่ทางเลือกลำดับต้นๆ ในการรักษา แต่ยังอาจพิจารณาใช้ในบางกรณีที่ต้องการลดความเสี่ยงของผลข้างเคียงรุนแรง เช่น เหงือกบวมหรือปัญหาทางระบบประสาทที่พบบ่อยกับฟีนิโทอิน