บูเตนาฟีน ไฮโดรคลอไรด์ ใช้กันอย่างแพร่หลายในการรักษาการติดเชื้อรา โดยเฉพาะที่ผิวหนัง มีประสิทธิภาพต่อเชื้อเดอร์มาโตไฟต์ ซึ่งทำให้เกิดโรคเช่น โรคน้ำกัดเท้า โรคเชื้อราที่ขาหนีบ และโรคเกลื้อน สารนี้ทำงานโดยยับยั้งการสังเคราะห์เออร์โกสเตอรอล ซึ่งเป็นส่วนประกอบสำคัญของเยื่อหุ้มเซลล์รา นำไปสู่การรบกวนเยื่อหุ้มและการตายของเชื้อรา คุณสมบัติต้านเชื้อราเข้มข้นทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบสำหรับการใช้เฉพาะที่ มักมีในรูปแบบครีมหรือเจล นอกจากนี้ บูเตนาฟีน ไฮโดรคลอไรด์ ยังมีผลที่ยาวนาน ต้องการการใช้ครั้งน้อยกว่าบางตัวต้านเชื้อรา ซึ่งช่วยเพิ่มการปฏิบัติตามของผู้ป่วยและผลลัพธ์การรักษา