AQ-13 dihydrochloride ถูกใช้หลักในการวิจัยทางการแพทย์ โดยเฉพาะในการศึกษาและการรักษาโรคมาลาเรีย สารนี้เป็นยาต้านมาลาเรียที่แสดงประสิทธิภาพต่อ Plasmodium falciparum ซึ่งเป็นปรสิตที่ก่อให้เกิดมาลาเรียชนิดรุนแรงที่สุด นักวิจัยกำลังสำรวจศักยภาพของมันในฐานะทางเลือกแทนยาต้านมาลาเรียแบบดั้งเดิม โดยเฉพาะในกรณีที่เกิดการดื้อยาเช่น chloroquine การประยุกต์ใช้รวมถึงการศึกษาก่อนคลินิกและคลินิกเพื่อประเมินความปลอดภัย ประสิทธิภาพ และเภสัชจลนศาสตร์ นอกจากนี้ AQ-13 dihydrochloride ยังถูกตรวจสอบกลไกการออกฤทธิ์เพื่อเข้าใจดีขึ้นว่ามันต่อสู้กับปรสิตมาลาเรียอย่างไร ซึ่งอาจนำไปสู่การพัฒนากลยุทธ์การรักษาใหม่