วิดาราบีนเป็นสารต้านไวรัสที่ใช้ในการรักษาการติดเชื้อไวรัสเฮอร์เพส รวมถึงไวรัสที่ก่อให้เกิดโรคเริมทั้งแบบที่ผิวหนังและในระบบประสาท โดยเฉพาะอย่างยิ่งใช้ในการรักษาเยื่อบุตาขาวอักเสบจากไวรัสเฮอร์เพสซิมเพล็กซ์ (Herpes simplex keratitis) ซึ่งเป็นการติดเชื้อที่ตา โดยมักใช้ในรูปของยาหยอดตาหรือยาขี้ผึ้งทาตา นอกจากนี้ วิดาราบีนยังเคยถูกใช้ในการรักษาโรคไข้เลือดออกระดับประสาทที่เกิดจากไวรัสเฮอร์เพส เช่น เอนซีฟาไลติสจากไวรัสเฮอร์เพส แม้จะมีการใช้น้อยลงในปัจจุบันเนื่องจากมียาตัวอื่นที่มีประสิทธิภาพดีกว่าและมีผลข้างเคียงน้อยกว่า เช่น แอซิโคลเวียร์ แต่วิดาราบีนยังคงมีบทบาทในบางกรณีที่ไวรัสดื้อยาหรือไม่สามารถใช้ยาอื่นได้