4-Fluoro-2-(p-tolylethynyl)benzaldehyde ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารตั้งต้นหลักในการพัฒนายาและสารประกอบชีวภาพที่มีฤทธิ์ มันมีบทบาทในการสร้างโมเลกุลที่มีศักยภาพในการรักษา โดยเฉพาะในการออกแบบยาที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการวิจัยเคมียารักษา นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์วัสดุขั้นสูง เช่น เซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์หรือผลึกเหลว เนื่องจากระบบคอนจูเกตและคุณสมบัติอิเล็กตรอนอุดมสมบูรณ์ การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การศึกษาความ fluorescen โดยสามารถรวมเข้าไปในโพรบสำหรับการถ่ายภาพหรือการตรวจจับ