ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งไคเนสและสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพอื่นๆ หมู่อัลดีไฮด์ช่วยให้สามารถดัดแปลงเป็นอนุพันธ์ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน กลุ่มไดฟลูออโรมีทอกซี่ช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ ซึ่งเป็นคุณสมบัติที่มีประโยชน์ในการออกแบบยา ใช้กันทั่วไปในเคมีทางการแพทย์สำหรับการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม (SAR) เนื่องจากสามารถปรับเปลี่ยนคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และ steric ของโมเลกุลเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตรและวัสดุฟังก์ชันนัลที่ต้องการชิ้นส่วนก่อสร้างอะโรมาติกที่มีฟลูออรีน