ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารเกษตรเคมีและโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ หมู่ difluoromethoxy ของมันช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและ lipophilicity ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการปรับปรุงยาตัวสมัคร ใช้บ่อยในการเตรียมสารกำจัดเชื้อราและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากความสามารถในการปรับปรุงการซึมผ่านของสารประกอบและความเสถียรในสิ่งแวดล้อม นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนซึ่งต้องการ motifs ที่ fluorinated เพื่อปรับแต่งคุณสมบัติอิเล็กทรอนิกส์และ steric