สารเคมีนี้ถูกนำมาใช้เป็นหลักในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตเภสัชภัณฑ์หลากหลายชนิด โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ซึ่งมีทั้งหมู่แอมิโนและกลุ่มฟลูออรีน ทำให้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) สารนี้มักถูกนำไปใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา รวมถึงสารที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและมะเร็ง นอกจากนี้ หมู่ hexafluoropropanol ยังช่วยเพิ่มความเสถียรและปฏิกิริยา ทำให้เป็นหน่วยย่อยที่มีประโยชน์ในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการค้นพบและพัฒนายา