1,3-Diphenoxybenzene ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารตัวกลางสำคัญในการผลิตโพลีเมอร์และเรซินต่างๆ โครงสร้างของมันทำให้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาวัสดุประสิทธิภาพสูง เช่น ของเหลวผลึกและสารเคลือบพิเศษ ซึ่งต้องการความเสถียรทางความร้อนและความต้านทานทางเคมี นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตรบางชนิด โดยคุณสมบัติอะโรมาติกช่วยให้มีปฏิกิริยาเคมีและความเสถียรตามที่ต้องการของผลิตภัณฑ์สุดท้าย ในงานวิจัย มักใช้เป็นสารตัวอย่างเพื่อศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาวิธีสังเคราะห์ใหม่ๆ